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简化基因组甲基化测序

产品介绍

    MethylRAD-seq(简化基因组甲基化测序)技术于2015年11月份发表在学术期刊《Open Biology》上(Wang et al., Open Biol., 2015)。MethylRAD是利用甲基化修饰依赖性内切酶,如FspEI、MspJI、LpnPI、AspBHI等,此类内切酶会识别DNA上发生甲基化的胞嘧啶,在识别位置的下游隔一定距离进行酶切;如果DNA两条链甲基化状态是对称的,那么就可以切割产生一个固定长度的双链DNA片段(~32bp)。对酶切产生的标签建库测序,即可进行甲基化位点的定性和相对定量检测。


    技术原理                                                                                         技术流程

                       

    技术优势

    ▪文库构建简便快速,保证了实验的重复性、标签的代表性,甲基化位点检测的假阳性率能够控制在0.5%以内
    ( WGBS假阳性率在0.28%-0.50%)
    ▪具有单碱基分辨率,可以做到甲基化位点的定性和定量分析
    ▪所需的样本DNA量极低,5ng的起始DNA量即可建库
    ▪具有极强的灵活性,可以控制获得甲基化位点的密度
    ▪DNA甲基化位点的检出不依赖于基因组序列信息,既可以用于未知甲基化位点的开发,也可用于不同样本间的甲
    基化位点的差异研究

    技术参数