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三代大基因组测序

产品介绍

    三代大基因组测序

    简介



    与二代测序最高不超过1 Kb的读长相比,PacBio Sequel的长读长将有效解决短序列数据的拼接难题。同时,与二代测序的模板样品需要扩增相比,PacBio Sequel无需扩增可直接对单个分子进行测序,有效避免了PCR扩增偏好性和GC偏好性,PacBio Sequel可轻松跨越GC含量异常(过高或过低)及高度序列重复的区域,实现序列覆盖的完整性和均一性。



    技术流程


    技术路线

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    建库流程

    2

     

    分析流程

    3

     分析内容


    基因组从头测序

    基于单分子实时测序技术,对动植物基因组进行测序及拼接组装(纯三代组装),解决多倍体、高杂合度、高度重复区域、异常GC含量区域等组装难题,重新定义大基因组的组装指标。基因组从头测序,在不依赖参考基因组的情况下对某物种进行基因组测序及拼接组装,从而绘制该物种的全基因组序列图谱。基因组测序不仅可以获得该物种的全基因组序列图谱,同时也为后续物种起源进化及特定环境适应性的研究奠定基础。


    4

    基因组组装升级

    基因组组装升级指的是利用三代测序超长读长的数据,对已经组装好的二代基因组进行组装优化,即二、三代混合测序。


    5

     

    基因组结构变异分析

    基于单分子实时测序技术,通过低覆盖深度测序,检测动植物全基因组中结构变异,为后续重测序分析提供更丰富的变异信息,解决目前NGS测序在结构变异检测的瓶颈,即采用低覆盖深度测序的方式检测基因组上存在的大片段结构变异。

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