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LC-MSMS&非标记定量

产品介绍

    LC-MSMS&非标记定量

    简介

    液相色谱(LC)根据不同蛋白(肽段)在流动相和固定相之间分配系数的差异而进行分离,液相色谱特别是
    多维液相色谱(MDLC)与串联质谱联用技术(LC-MSMS)是蛋白组分离分析的重要工具之一。该技术可以
    实现对复杂蛋白样品的分离鉴定,在此基础上,通过质谱信号强度可以实现对肽段和蛋白定量,快速找到
    不同样品间的蛋白表达差异,即非标记定量蛋白组分析。


    A . LC-MSMS混合蛋白鉴定及靶向蛋白组分析


    ·分辨能力高、数据丰富
    适用于复杂蛋白样品的分离鉴定分析,一次可以获得几十、几百甚至几千个蛋白的信息。


    ·应用范围广
    通过与特异类型蛋白富集及解析技术相结合,可以很好地实现靶向蛋白组学以及翻译后修饰蛋白组学分析。

    研究案例



    Sun N. et al., Proteomics analysis of cellular proteins Co-IP with nucleoprotein of influenza A virus (H7N9).
    2015, Int. J. Mol. Sci.
    运用LC-MS/MS技术对H7N9核蛋白互作的宿主细胞蛋白组进行分析,基于组学金豆(OmicsBean)系统进
    行互作蛋白生物信息学分析与病毒侵染复制分子模型构建

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    B . 非标记(Label-free)-SWATH定量蛋白质组



    ·不需要昂贵的标记
    直接根据色谱及质谱的峰面积进行蛋白定量,不需要同位素标记,实验耗费低。


    ·样品不受限制,无标记偏差
    与标记技术相比,非标记技术对于样品数量无限制,弥补了标记定量技术在对多个样本进行定量和定性方
    面的缺陷以及对于某些不易标记的蛋白/肽段检测效果不好的缺陷。


    ·实验要求高
    对LC-MSMS的稳定性和重复性要求较高,需要有足够的技术重复以确证结果,但该技术目前主要基于一
    维LC-MSMS,分离能力有限,一般适用于细胞器、胞外分泌液及微生物等复杂程度较低的样品。

    研究案例



    Igor F. et al., The physcomitrella patens chloroplast proteome changes in response to protoplastation.2016,
    Front Plant Sci.
    小立碗藓进行原生质体处理的叶绿体蛋白组响应


    实验材料
    小立碗藓原丝体和原生质体的叶绿体样品


    研究结论
    ·发现219个与原生质体处理相关的差异表达蛋白。
    ·叶绿素Ⅱ的生物合成以及相关叶绿体外膜蛋白处理后表达下调。
    ·活性氧(ROS)清除相关的功能得到增强。

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