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Illumina 850k芯片

产品介绍

    Illumina 850k甲基化芯片

    Illumina 850k甲基化芯片特点

    ① 权威甲基化芯片,针对人源样本研究性价比高;
    ② 高准确度可精确达到85万个甲基化位点;
    ③ 覆盖范围广,CpG岛及CpG岛以外均有覆盖;
    ③ 多种验证手段可供选择。

    Illumina 850k甲基化芯片介绍

    人类的许多疾病(包括癌症)是由于异常的甲基化引起的。Illumina甲基化芯片是一种DNA甲基化高通量筛选技术,精确到单个碱基的甲基化变化。单碱基分辨率实现了基因区域和CpG岛的全面覆盖。此外,还包括CpG岛之外的CpG位点、在人类干细胞中鉴定出的非CpG甲基化位点、miRNA启动子区域以及肿瘤和正常组织中差异表达的甲基化位点等,大大加速了甲基化研究发展,提升研究效率,并很有可能发展成为人类疾病诊断、预防和治疗的有效工具。

    Illumina 850k甲基化芯片技术特点

    ■ 流程简单,无需进行繁琐的免疫共沉淀;
    ■ 直接检测到发生甲基化的准确位点,而非发生甲基化的区段;
    ■ 可根据需求,灵活定制符合自己需求的个性化芯片;
    ■ 通量高,可一次性检测8个以上样品。

    Illumina 850k甲基化芯片技术流程

    Illumina 850k芯片技术流程-欧易生物

    Illumina 850k甲基化芯片分析流程

    Illumina 450k芯片

    Illumina 850k甲基化芯片技术参数

    Illumina 850k芯片技术参数-欧易生物

    案例展示

    案例一:I期非小细胞肺癌的DNA甲基化标志物

    为了探索I期非小细胞肺癌(NSCLC)可利用的生物标志物,本案例采用 Illumina 450K甲基化芯片对444例非小细胞肺癌样本进行研究,发现了10000个甲基化差异位点。基于这些位点进行非监督层次聚类分析,可以将患者明显区分为预后好坏两类。

    Illumina 850k芯片技术案例:I期非小细胞肺癌的DNA甲基化标志物-欧易生物
    图1. 非小细胞肺癌样本的非监督层次聚类分析

    案例二:甲基化芯片转录组联合分析

    本案例利用Illumina 450K甲基化芯片研究了多发性硬化影响的脑组织与正常脑组织的DNA甲基化差异,结果发现甲基化差异细微,但是差异是普遍存在的并且具有可重复性。通过RNA-seq研究发现,多发性硬化影响的脑组织相比正常脑组织,调节少突胶质细胞存活的基因,如BCL2L2和NDRG1是高甲基化的并且基因表达水平较低;而与蛋白水解加工相关的基因,如LGMN和CTSZ则是低甲基化并且基因表达水平较高。这些结果表明基因甲基化程度的改变会影响脑组织对于损伤的敏感性。

    Illumina 850k芯片技术案例:甲基化芯片与转录组联合分析-欧易生物
    图2. mRNA表达水平与启动子甲基化相关性分析

    参考文献

    [1] Sandoval J, Mendez-Gonzalez J, Nadal E, et al. A Prognostic DNA Methylation Signature for Stage I Non–Small-Cell Lung Cancer. Journal of Clinical Oncology, 2013; 31(32): 4140-4147.
    [2] Huynh J, Garg P, Thin T, et al. Epigenome-wide differences in pathology-free regions of multiple sclerosis- affected brains. Nature neuroscience, 2014; 17(1): 121-130.